MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 plasmid pBT9727

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006578	TCA	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006578	ATG	2	6	136	141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006578	TGC	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006578	TCT	2	6	183	188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006578	GA	3	6	223	228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006578	CTTCC	2	10	230	239	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_006578	T	7	7	242	248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006578	CAG	2	6	253	258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006578	CTT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006578	TCT	2	6	291	296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006578	TTG	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006578	T	6	6	393	398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006578	T	6	6	404	409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006578	ATC	2	6	422	427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006578	T	7	7	435	441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006578	TAC	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_006578	GTA	2	6	478	483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006578	CAC	2	6	897	902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_006578	AATA	2	8	907	914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006578	TC	3	6	927	932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006578	TTA	2	6	948	953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006578	TAAT	2	8	957	964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006578	TAT	2	6	1006	1011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006578	ACAGT	2	10	1016	1025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_006578	TAAA	2	8	1053	1060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006578	GTG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006578	T	7	7	1156	1162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006578	T	6	6	1196	1201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006578	TAAAA	2	10	2698	2707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006578	AG	3	6	7183	7188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006578	CT	3	6	7202	7207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_006578	TCA	2	6	7588	7593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006578	CCT	2	6	8071	8076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_006578	TA	3	6	11464	11469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006578	TCC	2	6	14116	14121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_006578	TA	3	6	16523	16528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006578	ATT	2	6	16542	16547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006578	GAA	2	6	16884	16889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006578	ACAG	2	8	16912	16919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_006578	CA	4	8	16949	16956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006578	CCCT	2	8	17426	17433	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_006578	CCT	2	6	19028	19033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_006578	T	6	6	20387	20392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006578	T	6	6	20788	20793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006578	TC	3	6	20801	20806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_006578	TAAAA	2	10	20821	20830	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006578	TAA	2	6	20842	20847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006578	CCT	2	6	20862	20867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_006578	TATT	2	8	20870	20877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006578	TA	3	6	20881	20886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006578	CTA	2	6	20892	20897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_006578	ATC	2	6	21013	21018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006578	CAC	2	6	21019	21024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_006578	T	7	7	21076	21082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006578	A	6	6	21087	21092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006578	CCTA	2	8	21123	21130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_006578	AG	3	6	25834	25839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006578	AATA	2	8	25840	25847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006578	ATA	2	6	25872	25877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006578	AAT	2	6	25894	25899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006578	TAAA	2	8	25921	25928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006578	AT	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006578	T	7	7	26232	26238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006578	TAG	2	6	26292	26297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006578	T	6	6	26301	26306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006578	TTA	2	6	26784	26789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006578	TCT	2	6	26798	26803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006578	T	6	6	26819	26824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006578	CTT	2	6	26842	26847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006578	CTA	2	6	26963	26968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006578	ATTAA	2	10	26978	26987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006578	GCT	2	6	27025	27030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006578	ATG	2	6	27031	27036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006578	TAA	2	6	27095	27100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006578	ATC	2	6	27135	27140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006578	CCTTT	2	10	27578	27587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_006578	ATTA	2	8	27592	27599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006578	CAAA	2	8	27600	27607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006578	A	6	6	27659	27664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006578	AGC	2	6	27666	27671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006578	CTA	2	6	27693	27698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006578	TTA	2	6	27709	27714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006578	CTT	2	6	29175	29180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006578	TTA	2	6	29181	29186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006578	CTT	2	6	29224	29229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_006578	TTC	2	6	29243	29248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_006578	AGC	2	6	29348	29353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006578	ATT	2	6	29382	29387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006578	TA	3	6	30550	30555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006578	TAA	2	6	30560	30565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006578	A	7	7	30564	30570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006578	AGC	2	6	30572	30577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006578	CA	3	6	30596	30601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_006578	A	7	7	30914	30920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006578	AAC	2	6	30960	30965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006578	CTT	2	6	31129	31134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006578	A	6	6	31175	31180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006578	T	7	7	31193	31199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006578	A	7	7	31225	31231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006578	TAA	2	6	31254	31259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006578	T	6	6	31263	31268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006578	TTA	2	6	31290	31295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006578	AAC	2	6	31307	31312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_006578	GCT	2	6	31334	31339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_006578	TAC	2	6	31354	31359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006578	ATG	2	6	31381	31386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006578	A	6	6	31512	31517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006578	CT	3	6	31543	31548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_006578	TA	3	6	32072	32077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006578	TTA	2	6	32109	32114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006578	AAG	2	6	33029	33034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006578	TTC	2	6	33039	33044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006578	AAT	2	6	33118	33123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006578	CAG	2	6	33161	33166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_006578	ACC	2	6	33208	33213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_006578	CTT	2	6	33267	33272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_006578	TA	3	6	33328	33333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006578	ATC	2	6	33356	33361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_006578	ATT	2	6	33380	33385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006578	CTG	2	6	33848	33853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006578	AAC	2	6	33861	33866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006578	TCAAC	2	10	33874	33883	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_006578	A	8	8	33954	33961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006578	A	6	6	33963	33968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006578	TTC	2	6	34002	34007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006578	GAA	2	6	34014	34019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006578	AAT	2	6	34050	34055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006578	AC	3	6	34094	34099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_006578	ATT	2	6	34113	34118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006578	TCA	2	6	34140	34145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006578	AAG	2	6	34182	34187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006578	TAG	2	6	34247	34252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006578	ACAA	2	8	34273	34280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_006578	GTC	2	6	34315	34320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006578	T	6	6	34327	34332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006578	T	10	10	34416	34425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006578	A	6	6	34442	34447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006578	ATTA	2	8	34535	34542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006578	ATT	2	6	34571	34576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006578	AAC	2	6	34627	34632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_006578	ATT	2	6	34669	34674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006578	CCA	2	6	34691	34696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_006578	TAA	2	6	34717	34722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006578	T	6	6	34735	34740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006578	CAG	3	9	34770	34778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_006578	AAT	2	6	34783	34788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006578	ATA	2	6	34821	34826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006578	A	7	7	36197	36203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006578	TA	3	6	36204	36209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006578	AT	3	6	36212	36217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.